In het onderdeel 'Probleemanalyse en beleidsalternatieven' worden de volgende onderwerpen behandeld:
Dit onderdeel gaat in op de eerste drie stappen van de MKBA, te weten de probleemanalyse , het nulalternatief en de beleidsalternatieven. De onderdelen kennen een identieke opzet. Elk onderdeel begint met een samenvatting van de richtlijnen en adviezen voor opdrachtgevers en opstellers van een MKBA. Vervolgens wordt kort ingegaan op de toelichting over het onderwerp in de Algemene MKBA-leidraad. Tot slot volgt een nadere uitwerking en toelichting.