Gebruik voor de raming van kosten van infrastructuur de Standaard Systematiek Kostenramingen (SSK). Daarbij wordt onderscheid gemaakt naar aanlegkosten, inpassingskosten en beheer- en onderhoudskosten (inclusief vervangingsinvesteringen). In de verkenningsfase van MIRT-projecten dient in de MKBA gebruik te worden gemaakt van ramingen van kosten voor zowel aanleg als beheer en onderhoud. Deze kosten moeten getoetst zijn aan de geldende richtlijnen van Grote Projecten en Onderhoud (GPO) van Rijkswaterstaat. 

Let erop, dat de risico-opslag die in de SSK-raming zit, niet onterecht als kostenpost meegenomen wordt in de MKBA. Risico’s dienen separaat aan te worden gegeven in een MKBA (zie de laatste stap in het genoemde stappenplan uit de Algemene MKBA-leidraad). Afhankelijk van de situatie kan dit op basis van de verwachte waarde (kans maal gevolg), door een vergelijking tussen beleidsalternatieven en eventuele varianten daarop, door toekomstscenario’s, door gevoeligheidsanalyses, en via de opslag op de discontovoet.